참여연대 등 전국 124개 시민단체들로 구성된 '제주해군기지 건설 저지를 위한 전국대책회의'는 22일 안철수 서울대 융합과학기술대학원장이 저서 <안철수의 생각>에서 제주해군기지 건설은 YS정부이래 4개 정부가 추진해 온 사업이므로 필요하다고 한 데 대해 안 원장이 해군측 주장에 근거해 사실을 왜곡하고 있다고 비판했다. 대책회의는 이날 논평을 통해 안 원장 주장에 대해 "김영삼 정부 시절, 제주해군기지 건설이 국방부 소요에 반영된 156차 합동참모회의(1993년 12월) 이후 국방부가 제주해군기지 건설을 시도해 온 것은 사실이지만, 정부의 공식적인 계획으로 확정된 것은 2006년부터"라며 "이전 4개 정부가 추진했다는 안 교수의 잘못된 판단은 제주해군기지 논란에 대해 객관적이고 정확한 정보 없이 해군의 홍보용 주장을 무비판적으로 그대로 답습한 탓에 비롯된 것"이라고 질타했다. 대책회의는 이어 "군의 의도나 계획으로 말하자면 군은 제주도에 해군기지는 물론, 공군기지를 건설하는 것을 중기계획에 포함하고 있다. 이 경우 대공미사일 부대, 탄약고와 무기고도 새롭게 들어올 것이 자명하다. 제주도가 대규모 병참기지로 둔갑하게 되는 것"이라며 "안철수 교수는 이전 정부에서 군이 이러한 계획을 중기계획에 반영했다는 이유로 제주도에 공군기지도 병참기지도 모두 불가피하다고 주장할 것인가"라고 반문했다. 대책회의는 "새누리당 박근혜 위원장이 언급했던 하와이의 경우 해군기지가 건설된 이후 환경오염으로 자연생태계가 파괴되고, 1,100개의 고유한 천연동식물중 약 82%가 위험해 처해 있다는 것은 널리 알려진 사실"이라며 "안 교수는 박근혜 위원장의 발언처럼 제주도가 생태계가 파괴된 하와이처럼 변하길 바라는 지 묻지 않을 수 없다"고 안 교수와 박 전 위원장을 싸잡아 질타하기도 했다.
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